El Consejo Rector está formado por un número de Consejeros no inferior a cinco ni superior a nueve y administra la Fundación. Los miembros del Consejo Rector permanecen en sus cargos por tres períodos de gestión. El Consejo Rector se reúne, a iniciativa del Presidente y en la sede de la Fundación, al menos tres veces al año o también a petición motivada, dirigida al Presidente, de al menos cuatro Consejeros o de un Consejero y el Coordinador. Corresponde al consejo de administración, en particular: nombrar a los miembros del órgano de control; nombrar al Coordinador de la Fundación, atribuyéndole delegaciones operativas; aprobar el informe de gestión, el presupuesto y el balance final; aprobar el plan de actividades así como las direcciones estratégicas de la Fundación. La actividad de los Consejeros que forman parte del Consejo Rector se realiza, debido a los objetivos institucionales que persigue la Fundación, de forma totalmente gratuita.

El Consejo de Administración podrá nombrar asesores técnicos si determinadas actividades de la Fundación requieren dicho apoyo. La Fundación cuenta con el apoyo científico de tres Asesores Técnicos con experiencia en el campo neonatal, para la parte relacionada con el programa NEST, y con experiencia en el campo respiratorio, para el programa GASP. Los Asesores Técnicos actúan de forma autónoma y responsable, pero en armonía con el Coordinador de la Fundación, teniendo en cuenta la misión solidaria y sin fines de lucro de la Fundación. La actividad de los Asesores Técnicos se realiza, debido a los objetivos institucionales que persigue la Fundación, de forma gratuita. Se permite el reembolso de gastos de viaje, debidamente documentados. En casos excepcionales y específicos, que el propio Consejo debe reconocer como tales después de haber recabado el dictamen del Órgano de Control, podrá concederse el reembolso de los meros gastos realizados por los miembros.